تسعى للتميز محلياً وإقليمياً في مجالات العلوم النظرية والتطبيقية والبحوث العلمية النظرية منها والعملية, وذلك لخدمة المجتمع وفق معايير الجودة الشاملة.تعتبر كلية العلوم من أول الكليات في جامعة الأقصى، حيث تم إنشاؤها في عام 1991 وبإمكانيات متواضعة، ثم استمر هذا التطوير من حيث المختبرات والكفاءات العلمية حتى أصبحت تضاهي كليات العلوم العالمية. ساهمت الكلية في تطوير المجتمع الفلسطيني، وذلك من خلال تزويده بالخريجين المؤهلين للعمل في جميع التخصصات العلمية الصادرة عن الكلية.
تتميز كليتنا بأن لديها هيئة تدريسية ذات كفاءة عالية تعمل بروح الفريق وأهم ما يميزها هو روح الانسجام والمحبة والتعاون، حيث تعمل بكل جد وتفان من أجل مساعدة الطلاب وتشجيعهم على الحوار والانفتاح على الثقافات المختلفة للارتقاء بمستوى تعليمي جامعي ينعكس على أدائهم المهني في أماكن عملهم.
