تحتوي كلية الفنون الجميلة في جامعة الأقصى على ثلاثة أقسام أكاديمية متميزة في التخصصات الفنية النوعية والتي تتواءم مع احتياجات سوق العمل وهم:
- قسم الفنون التشكيلية \ تصميم جرافيك
- قسم التربية الفنية والفنون الرقمية
- قسم الديكور والتصميم الداخلي
